Šodien muzeja krājumā ir vairāk nekā pusmiljons priekšmetu, kas sistematizēti 75 kolekcijās.
Muzejs šķiet esam atvērts sadarbībai, tas piedāvā iespēju izīrēt kolonnu zāli dažādiem pasākumiem, izīrēt priekšmetus filmu veidošanai vai citai radošai darbībai, un, protams, arī izmantot krājumu mācību un pētniecības vajadzībām, kā arī muzejā ir pieejama specializētā bibliotēka
Mūsdienās Muzejam ir trīs filiāles: Ainažu jūrskolas muzejs (atvērts 1969. gadā Ainažos) un Rīgā – Mencendorfa nams. Rīdzinieku 17.–18. gs. māja-muzejs (1992) un Latvijas Fotogrāfijas muzejs (1993). Daļa Doma muzeja unikālās vērtības pēc tā reorganizācijas 1936.gadā atrodas arī Latvijas Nacionālajā vēstures muzejā, Latvijas Kara muzejā, Paula Stradiņa Medicīnas vēstures muzejā, Latvijas Dabas muzejā, Mākslas muzejā Rīgas birža un Latvijas Nacionālajā mākslas muzejā.
…