Latvijas un Igaunijas divpusējās attiecības, galvenokārt ekonomiskās attiecības, kopš 2004. gada 1. maija regulē ES iekšējā tirgus noteikumi. Lielākā daļa līgumu, kas saista Igauniju un Latviju, ir noslēgti trīspusēji-starp Igauniju, Latviju un Lietuvu. Starp Latviju un Igauniju ir noslēgti 15 divpusējie līgumi.
Latvijas un Igaunijas ekonomiskās attiecības arī ir cieši saistītas esot kā tirdzniecības partneriem, esot nozīmīgiem eksporta un importa partneriem.
Lai arī abas ir Baltijas valstis un salīdzinoši līdzīgas tomēr Igaunija ir ātri sapratusi, ka mazai valstij ar ierobežotu resursu daudzumu ir kritiski svarīgi īstenot liberālo ekonomisko politiku, būt atvērtai pret pasauli un pēc iespējas vairāk tajā iekļauties. Veiksmīga nodokļu sistēmas sakārtošana un privatizācija, kas Igaunijā norisēja raiti un ātri, veicinot ārvalstu investīcijas, un prātīga rīkošanās ar valsts finansēm sekmēja Igaunijas ekonomikas virzīšanos nosprausto mērķu sasniegšanā ir panākusi, ka esošā valsts politika ir vērsta uz izaugsmi un panākumiem, arī pašiem uzņēmējiem salīdzinot ar Latviju un Lietuvu ir ērtāk un vieglāk darboties tieši Igaunijā.