Komplementaritāte - divu vai vairāku gēnu mijiedarbības rezultātā, organismā izpaužās kāda jauna pazīme, kura nav saistīta ar nevienu no šiem gēniem atsevišķi. Lai saprastu šo mijiedarbību, kā vizuālu paraugu var iedomāties ķīmisku reakciju, kad salejot kopā sārma un fenolftaleīna šķīdumus, kas ir bez krāsas, iegūst tumši sarkanu šķīdumu.
Pirmajā gadījumā, divas dominantās allēles, katra savā lokusā dos atšķirīgus fenotipus, ne kā tad, ja tās, katra būtu dominanta savā lokusā ja otra lokusa abas alēles ir recesīvas. Taču abos lokusos visām alēlēm veidojas cits fenotips nekā iepriekšējiem gadījumiem.
Piemēram, sakrustojot balto sīpolu ar dzeltenu sīpolu, F1 paaudzē augiem ir sarkani sīpoli, bet F2 paaudzē 9/16 augu sīpoli ir sarkani, 3/16 dzelteni, bet 4/16 balti sīpoli. Viena dominantā alēle darbojas patstāvīgi un nosaka dzelteno krāsu, bet otrs gēns iedarbojas komplementārā gēna klātbūtnē.
…
