1. Vispārīgs raksturojums
AlphaFold ir mākslīgā intelekta (AI) programma, ko ir izveidojis Alphabets's/Google's
DeepMind. Ar šīs programmas palīdzību ir iespējams prognozēt proteīna struktūras, tā ir
veidota kā dziļas mācīšanās programma.
Alphafold programmai ir divas galvenās versijas. 2018.gadā pētnieku grupa veicot
proteīnu pētīšanu, izmantoja AlphaFold1 ieņēma pirmo vietu 13. proteīna struktūras
prognozēšanas metožu kritiskā novērtējuma (CASP) kopējā reitingā. Īpaši veiksmīga šī
programma bija, lai paredzētu struktūru objektiem, un šī kvalifikācija bija novērtēta kā
visgrūtākā no visiem CASP kopējā reitingā, tāpēc ka nebija pieejamas esošās veidņu
struktūras no proteīniem ar daļēji līdzīgu secību.
Savukārt pēc AlphaFold2 izstrādāšanas, komanda sasniedza vēl precīzākus rezultātus un
augstāku līmeni nekā jebkura cita grupa. Komandai izdevās iegūt 90 punktus CASP globālā
attāluma testā (GDT), kas mēra pakāpi, kādā skaitļošanas programmas prognozētā struktūra
ir līdzīga laboratorijas eksperimentā noteiktajai struktūrai, kur 100 ir pilnīga atbilstība.
AlphaFold2 rezultāti tika atzīti kā pārsteidzoši labi un revolucionāri, neskatoties uz to, ka
daži pētnieki norādīja, ka ticamība nav pietiekami liela, lai uzskatītu, ka pilnībā ir atrisināta
olbaltumvielu locīšanās problēma, tomēr programmas veidotāji ir ieguvuši plašu cieņu pret to
tehniskajiem sasniegumiem. …
