ES Muitu dienestu mērķi sadarbībā ar citām institūcijām:
1. Nodrošināt nodokļu un nodevu precīzu samaksu
Parasti, lai izlaistu preces brīvam apgrozījumam, jāveic valstī paredzēto muitas maksājumu nomaksa, kuru iekasēšana uzdota muitai un visi šie maksājumi tiek ieskaitīti valsts budžetā. Pamatā visā pasaulē muita iekasē ievedmuitas un izvedmuitas nodokļus, kā arī tiem pielīdzinātos maksājumus.
2. Īstenot un uzturēt sabiedrības drošību un drošumu
Sabiedrības aizsardzība, kontrolējot konvencionāli aizliegto preču pārvietošanu pāri Latvijas Republikas robežai.
Narkotiku, psihotropo vielu, prekursoru, stratēģiskās nozīmes preču, kodolmateriālu, ieroču un radioaktīvo vielu kontrole.
3. Aizsargāt ES dalībvalstu iekšējo tirgu…